ในขั้นตอนการดำเนินงาน จะเป็นขั้นตอนที่ต้องพัฒนาชิ้นงาน หรือดำเนินกิจกรรมเพื่อให้ได้งานสำหรับส่งมอบ โดยขั้นตอนการพัฒนา แบ่งออกได้เป็น 3 ขั้นตอนดังนี้
1. การเตรียมการ
ในการดำเนินงานตามกิจกรรมแต่ละกิจกรรมที่ได้วางแผนไว้ ต้องเตรียมทรัพยากรให้พร้อมตามที่ระบุไว้ในขั้นตอนการวางแผน
2. การลงมือพัฒนา
ในขั้นตอนนี้ ควรมีการบันทึกความเปลี่ยนแปลงอย่างสม่ำเสมอ
3. การทดสอบและแก้ไข
เป็นการทดสอบผลลัพธ์ว่าตรงตามวัตถุประสงค์และขอบเขตหรือไม่ หากไม่ตรงให้แก้ไขจนกว่าจะได้ผลลัพธ์ตามต้องการ นอกจากนี้ผู้จัดทำโครงงานควรมีการจดบันทึกปัญหาและอุปสรรค์ต่างๆ ที่พบ รวมถึงวิธีการแก้ไข เพื่อนำไปปรับปรุงการพัฒนาโครงงานต่อไป
กิจกรรม
นักเรียนลงมือดำเนินการพัฒนาชิ้นงาน หรือดำเนินกิจกรรมเพื่อให้ได้งานสำหรับส่งมอบ